More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2122 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  100 
 
 		 511 aa  1027    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  62.17 
 
 		 501 aa  624  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  49.3 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.19 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  48.19 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  48.9 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  48.19 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  48.19 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  48.12 
 
 		 507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.79 
 
 		 496 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  48.19 
 
 		 501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  48.19 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  48.3 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  47.79 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  47.59 
 
 		 516 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  47.99 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  47.51 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  47.59 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  48.59 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  47.59 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  47.79 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  47.59 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  46.99 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  46.79 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49.02 
 
 		 525 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  47.79 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  47.7 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.28 
 
 		 525 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  47.5 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.67 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  46.35 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.31 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.59 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  50.4 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  47.41 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  47.28 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.98 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  48.39 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.49 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  47.61 
 
 		 505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.77 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.91 
 
 		 514 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.71 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  45.09 
 
 		 521 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.71 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.71 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.8 
 
 		 524 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.27 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.91 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.27 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.93 
 
 		 524 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  46.6 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.2 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.6 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  46.12 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.6 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  44.6 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.15 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 		 513 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  44.6 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  46.22 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  44.2 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  44.33 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  46.22 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.59 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  45.03 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  47.11 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  44.09 
 
 		 511 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  44.58 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 		 511 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 513 aa  435  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 513 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.06 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  44.35 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  46.43 
 
 		 511 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  45.51 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  46.12 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.96 
 
 		 513 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  43.89 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  48.29 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>