More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1715 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  100 
 
 		 330 aa  218  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  100 
 
 		 265 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  100 
 
 		 330 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1715  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD, truncation  100 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  99.12 
 
 		 330 aa  217  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  88.18 
 
 		 332 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  88.18 
 
 		 332 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  88.18 
 
 		 332 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  88.18 
 
 		 332 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  88.18 
 
 		 332 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  87.04 
 
 		 333 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  87.04 
 
 		 333 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  86.11 
 
 		 333 aa  184  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  70.27 
 
 		 327 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  70.09 
 
 		 327 aa  150  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  64.58 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  64.58 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  47 
 
 		 329 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  47 
 
 		 329 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 220 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  47.47 
 
 		 338 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  47.47 
 
 		 338 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  47.47 
 
 		 338 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  47.47 
 
 		 329 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  47.47 
 
 		 215 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  47 
 
 		 329 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 333 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 334 aa  67.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  39.77 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  50 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  41.28 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  41.58 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  35.92 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  42.7 
 
 		 337 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 		 318 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 		 318 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 342 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 		 332 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 330 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 		 337 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  41.18 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.08 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.78 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.71 
 
 		 311 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.71 
 
 		 311 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  38.2 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 		 338 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 		 338 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  43.18 
 
 		 327 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 312 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  38.2 
 
 		 329 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 332 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3273  putative ABC transporter, permease protein,y4mJ-like protein  32.58 
 
 		 332 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.715289  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  41.11 
 
 		 374 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 360 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  41.57 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 373 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.56 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  38.27 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.56 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.06 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.89 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.44 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  40.74 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  40.74 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  35.71 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  40.74 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.89 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>