More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1861 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  100 
 
 		 405 aa  788    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  58.01 
 
 		 390 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  55.7 
 
 		 410 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  49.74 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  41.96 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 		 383 aa  315  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  47 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  45.01 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  51.4 
 
 		 392 aa  306  6e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  43.26 
 
 		 396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  43.08 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  45.94 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  42.49 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  48.09 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  42.08 
 
 		 396 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  44.96 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  47.91 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  45.92 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.98 
 
 		 399 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  40.73 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  41.95 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  46.13 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  44.9 
 
 		 420 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  44.99 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.83 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  43.72 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  43.88 
 
 		 423 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  40.57 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  41.13 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  41.04 
 
 		 383 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  46.89 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  40.77 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  38.21 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  36.61 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  36.61 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  38.78 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  36.5 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 394 aa  206  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  40 
 
 		 357 aa  203  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  37.56 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  39.12 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 398 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  39.38 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  39.38 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  38.94 
 
 		 389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  38.42 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  39.13 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  31.79 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  31.75 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  33.94 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  34.28 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>