More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0584 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  100 
 
 		 357 aa  690    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  72.47 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  72.19 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  72.47 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  71.91 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  71.27 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  70.99 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  71.19 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  70.9 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  71.59 
 
 		 390 aa  464  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  70.06 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  60.56 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  57.95 
 
 		 388 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  54 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  54.67 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  53.98 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  55.49 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  53.24 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  52.42 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  52.54 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  52.54 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  52.14 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  52.42 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  52.14 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  52.14 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  51.27 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  47.71 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  51.41 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  51.85 
 
 		 399 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  51.57 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  53.04 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  51.56 
 
 		 378 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  50.42 
 
 		 378 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  50.7 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  50.7 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.71 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  40.93 
 
 		 399 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  46.59 
 
 		 402 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  46.59 
 
 		 402 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  39.57 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.74 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.16 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  45.48 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 403 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  40.97 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  38.27 
 
 		 396 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  40.22 
 
 		 392 aa  222  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  39.3 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  41.23 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  42.27 
 
 		 392 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  36.52 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 432 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 432 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.33 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  40.98 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 412 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.15 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>