More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3040 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  100 
 
 
381 aa  733    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  55.59 
 
 
388 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  52.97 
 
 
394 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  52.97 
 
 
394 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  52.97 
 
 
394 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  53.64 
 
 
376 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  52.41 
 
 
394 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  51.32 
 
 
394 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  50.54 
 
 
393 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  50.27 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  52.03 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  47.67 
 
 
397 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  51.34 
 
 
393 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  51.99 
 
 
390 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.23 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  55.49 
 
 
357 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  48.31 
 
 
403 aa  326  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  48.77 
 
 
399 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  48.77 
 
 
399 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  48.77 
 
 
399 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  47.62 
 
 
398 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  46.83 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  48.67 
 
 
373 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  48.21 
 
 
399 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  47.66 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  48.48 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  48.48 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  47.66 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  48.6 
 
 
399 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  47.38 
 
 
399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.77 
 
 
378 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  48.5 
 
 
378 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  47.97 
 
 
378 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  45.68 
 
 
389 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  41.6 
 
 
399 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  39.59 
 
 
400 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  45.26 
 
 
427 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.06 
 
 
400 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  45.53 
 
 
389 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  40.42 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  40.37 
 
 
410 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  42.82 
 
 
402 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  42.82 
 
 
402 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  40.05 
 
 
404 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  43.1 
 
 
398 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  35.09 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  37.43 
 
 
396 aa  232  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  35.96 
 
 
392 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  40.93 
 
 
403 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  39.83 
 
 
392 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  34.72 
 
 
405 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  37.08 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  40.11 
 
 
414 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
390 aa  226  6e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  36.29 
 
 
403 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  39.95 
 
 
390 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.92 
 
 
393 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  38.15 
 
 
369 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  36.13 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
401 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
410 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  39.05 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  39.07 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  38.4 
 
 
410 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.65 
 
 
393 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  37.6 
 
 
405 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  32.66 
 
 
452 aa  209  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
432 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
390 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
429 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  36.09 
 
 
435 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  38.96 
 
 
412 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  36.11 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
411 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  38.32 
 
 
392 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  37.18 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
420 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  36.66 
 
 
410 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
432 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  34.66 
 
 
432 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
406 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  36.2 
 
 
405 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
407 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  35.17 
 
 
396 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 
402 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>