More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1867 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
376 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  64.61 
 
 
394 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  64.61 
 
 
394 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  64.61 
 
 
394 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  65.05 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  63.3 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  63.3 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  64.15 
 
 
394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  62.47 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  62.37 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  61.93 
 
 
393 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  62.2 
 
 
393 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  62.2 
 
 
393 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  62.2 
 
 
393 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  62.2 
 
 
393 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  62.2 
 
 
393 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  62.2 
 
 
393 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  61.93 
 
 
393 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  61.93 
 
 
393 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  60.56 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  51.37 
 
 
388 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  56.21 
 
 
403 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  49.19 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  53.64 
 
 
381 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  52.57 
 
 
399 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  48.63 
 
 
383 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  53.52 
 
 
400 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  53.52 
 
 
400 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.3 
 
 
378 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  54 
 
 
398 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  52.07 
 
 
399 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  52.89 
 
 
399 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  52.28 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  52.28 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  52.3 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  52.03 
 
 
378 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  51.9 
 
 
405 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  52.72 
 
 
399 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  52.45 
 
 
399 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  53.24 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  49.19 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  44.96 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.92 
 
 
427 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
399 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.65 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  47.79 
 
 
402 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  47.79 
 
 
402 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.58 
 
 
400 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  39.2 
 
 
410 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 
396 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.05 
 
 
399 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  37.43 
 
 
394 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
403 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
414 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  47.49 
 
 
398 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  37.77 
 
 
383 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
396 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  38.32 
 
 
404 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
392 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  38.73 
 
 
396 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
403 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  38.16 
 
 
393 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.68 
 
 
393 aa  236  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  39.89 
 
 
369 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  38.21 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 
392 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  41.76 
 
 
390 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  41.44 
 
 
429 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 
405 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  40.43 
 
 
410 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  38.3 
 
 
410 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  37.93 
 
 
401 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  38.67 
 
 
404 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
432 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
402 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  35.32 
 
 
432 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  39.57 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 
390 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  38.25 
 
 
437 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.37 
 
 
393 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
432 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
432 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  36.95 
 
 
406 aa  205  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  38.42 
 
 
420 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
452 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  40.11 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
444 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  34.65 
 
 
435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 
408 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  38.71 
 
 
405 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
399 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  36.09 
 
 
396 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  40.49 
 
 
412 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
410 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>