More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 393 aa  763    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  76.84 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  75.77 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  73.47 
 
 		 392 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  74.05 
 
 		 392 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  72.03 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  70.51 
 
 		 392 aa  494  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  68.21 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  55.41 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  55.44 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  50.66 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  50.4 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  50.13 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  49.74 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  49.07 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 410 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  52.53 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  49.74 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  54.88 
 
 		 410 aa  330  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  51.95 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  46.19 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  47.84 
 
 		 404 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  47.48 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.61 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  46.44 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  48.45 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 403 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  48.83 
 
 		 390 aa  311  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  47.41 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  45.29 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  46.74 
 
 		 405 aa  302  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  46.19 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  45.62 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  52.65 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  48.94 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 423 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  39.49 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  46.4 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  42.52 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  41.88 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  42.43 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  42.43 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  42.43 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 393 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  41.51 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  41.84 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  42.74 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  41.11 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 		 378 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  38.86 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  38.86 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  39.84 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  40.88 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  40.88 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 378 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 405 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  36.15 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 427 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  40.61 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  35.66 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  31.88 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>