More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2886 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  97.35 
 
 		 378 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  100 
 
 		 378 aa  735    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  91.8 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  69.23 
 
 		 399 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  69.76 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  69.79 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  68.97 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  69.23 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  69.15 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  69.15 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  69.23 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  70.29 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  68.97 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  68.97 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  69.25 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  60.48 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  57.7 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  60.96 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  60.96 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  53.7 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  53.7 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  53.7 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  57.18 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  52.7 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  54.37 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  53.64 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  54.1 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  57.14 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  57.44 
 
 		 389 aa  358  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  51.05 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 393 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  61.23 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  56.15 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  49.59 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  53.68 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.68 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.68 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.68 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  53.68 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.68 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  53.72 
 
 		 393 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  53.72 
 
 		 393 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.68 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  48.5 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  51.55 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  49.86 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.72 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  46.01 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  38.5 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  40.05 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  37.84 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.87 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  37.47 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.64 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 432 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 432 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  37.9 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  35.38 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  38.42 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  36.46 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 401 aa  215  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  39.89 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  38.35 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  35.32 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  37.93 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  36.48 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  36.67 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.65 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.39 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>