More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0504 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 392 aa  753    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  70.51 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  70.08 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  72.82 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  68.97 
 
 		 392 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  65.65 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  68.06 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  65.98 
 
 		 393 aa  434  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  57.03 
 
 		 412 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  51.4 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  56.02 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  49.08 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  47.94 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  48.82 
 
 		 383 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  48.82 
 
 		 400 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  48.2 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 410 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  50.13 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.06 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  48.41 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  46.07 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  46.88 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  52.11 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  51.06 
 
 		 390 aa  315  8e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  47.09 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  53.02 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  49.07 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  48.29 
 
 		 426 aa  298  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  45.69 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  45.85 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  49.6 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  39.79 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  43.54 
 
 		 420 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  47.06 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  45.09 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  45.57 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  51.05 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  39.69 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  40.96 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  39.9 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  39.9 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  41.22 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  41.49 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  41.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  42.78 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  42.78 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  41.76 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  41.49 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  41.49 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  41.76 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  41.55 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  41.34 
 
 		 403 aa  229  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  38.82 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  40.43 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.39 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  42.93 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  41.73 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  40.94 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  40.16 
 
 		 402 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  40.16 
 
 		 402 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 		 427 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 378 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 432 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  34.89 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  39.73 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  32.77 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  35.2 
 
 		 420 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 432 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>