More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3838 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 402 aa  783    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 402 aa  783    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  88.81 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  61.69 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  61.69 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  61.35 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  59.45 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  65.43 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  61.6 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  61.6 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  61.54 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  61.54 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  64.21 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  63.99 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  59.89 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  64.61 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  60.16 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  60.96 
 
 		 378 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  56.99 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  52.97 
 
 		 389 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  47.73 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  47.73 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  47.73 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.47 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  49.45 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  47.79 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  47.25 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 393 aa  302  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  47.99 
 
 		 388 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  46.32 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  48.47 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  48.19 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  46.59 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  41.92 
 
 		 373 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  42.82 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.75 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  48.75 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.75 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.75 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.75 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  48.75 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  48.75 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  48.47 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.26 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  48.47 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  37.98 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  35.68 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.88 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  40.27 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  35.75 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.98 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  39.15 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  37.53 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  36.41 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  34.52 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.76 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  37.59 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  40.16 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  38.1 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  33.5 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  40.17 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  40.16 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  37.57 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  40 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  37.39 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>