More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5023 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  100 
 
 		 396 aa  775    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  44.05 
 
 		 444 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  44.34 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  47.94 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2926  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.519416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 		 432 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3186  inner-membrane translocator  44.5 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 432 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  38.2 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3113  inner-membrane translocator  44.15 
 
 		 437 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.645278  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  47.33 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  39.58 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  35.98 
 
 		 376 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  35.51 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  35.06 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  35.06 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  38.67 
 
 		 357 aa  212  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  36.75 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  37.67 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  38.2 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  37.53 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  37.24 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  36.29 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  35.73 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  35.73 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  36.67 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.36 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  34.83 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  34.83 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  36.15 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.42 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  36.57 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  38.01 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  38.01 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  36.48 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 410 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  35.92 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 392 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  38.59 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  33.25 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  33.42 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  31.07 
 
 		 392 aa  166  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>