More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0059 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 394 aa  773    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  85.03 
 
 		 393 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  88.8 
 
 		 394 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  84.52 
 
 		 393 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  99.75 
 
 		 394 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  99.75 
 
 		 394 aa  770    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  83.72 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  84.05 
 
 		 393 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  84.3 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  84.3 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  84.3 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  84.3 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  84.3 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  84.3 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  84.05 
 
 		 393 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  84.05 
 
 		 393 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  84.95 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  84.68 
 
 		 390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  65.07 
 
 		 376 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  72.19 
 
 		 357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  53.11 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  51.3 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  50.13 
 
 		 383 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  52.97 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  51.88 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  54.6 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  53.19 
 
 		 399 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  53.39 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  53.39 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  53.43 
 
 		 403 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  53.7 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  52.05 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  53.26 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  51.63 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  51.63 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  51.38 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  52.48 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  52.65 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  53.7 
 
 		 378 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  55.11 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  52.12 
 
 		 389 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.3 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  43.05 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  51.06 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  50.8 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  47.73 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  47.73 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  38.79 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  38.42 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.47 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  38.17 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.24 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  48.85 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  39.9 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  39.95 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  40.86 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  37.89 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  37.1 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  40.37 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  35.7 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  38.52 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  34.03 
 
 		 392 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  40.1 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 410 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  34.03 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 432 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 432 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 407 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.07 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>