More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2926 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3186  inner-membrane translocator  97.25 
 
 		 437 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2926  inner-membrane translocator  100 
 
 		 437 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.519416 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  77.29 
 
 		 444 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  70.94 
 
 		 437 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3113  inner-membrane translocator  65.68 
 
 		 437 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.645278  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  50.35 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  50.92 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  51.52 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  50.81 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  52.11 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  51.04 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  49.05 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 396 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  37.53 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  39.56 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  37.86 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 		 400 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  35.93 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  34.94 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  34.94 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  37.78 
 
 		 376 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 393 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  35.43 
 
 		 394 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  35.75 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  36.9 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 381 aa  197  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  36.47 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 410 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  34.22 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  33.26 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  34.42 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  34.42 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  37.37 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 378 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 403 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 402 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 402 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  31.67 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.75 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.78 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  34.79 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  35.68 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  34.53 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  33.49 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  32.94 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 392 aa  161  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  33.49 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  33.98 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  31.81 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  36.34 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  33.41 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.5 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>