More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2851 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  100 
 
 		 426 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  62.88 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  51.35 
 
 		 496 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  47.94 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  50 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  48.21 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  46.83 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  44.31 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  44.62 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  44.13 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 417 aa  255  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  45.12 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.05 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  44.85 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  45.52 
 
 		 415 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  39.75 
 
 		 415 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  46.58 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 438 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  38.35 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  37.36 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  34.17 
 
 		 472 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  36.77 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  43.63 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  34.33 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 397 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 496 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  33.85 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  34.88 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  34.88 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  33.42 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  33.42 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  33.42 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  33.42 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  35.77 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  32.27 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  29.38 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 398 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.77 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  34.93 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 410 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3186  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  32.45 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>