More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1180 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1103  inner-membrane translocator  89.44 
 
 
423 aa  675    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.660627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
426 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0258  Monosaccharide-transporting ATPase  60.05 
 
 
420 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  58.7 
 
 
452 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  53.16 
 
 
429 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  49.6 
 
 
394 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  46.65 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  46.7 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  47.76 
 
 
383 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  46.65 
 
 
400 aa  336  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  48.31 
 
 
393 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  46.58 
 
 
399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  45.36 
 
 
410 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  46.97 
 
 
396 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  47.41 
 
 
393 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  45.92 
 
 
405 aa  311  2e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  46.19 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  51.28 
 
 
420 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  49.49 
 
 
408 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  43.78 
 
 
404 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  45.78 
 
 
403 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  48.82 
 
 
410 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  48.03 
 
 
392 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  43.23 
 
 
403 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  48.05 
 
 
393 aa  289  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  43.23 
 
 
403 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  46.82 
 
 
390 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  43.39 
 
 
414 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  47.24 
 
 
392 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  41.49 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  43.78 
 
 
405 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  43.16 
 
 
402 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  46.7 
 
 
408 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  43.95 
 
 
410 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  44.62 
 
 
392 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  47.3 
 
 
412 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0758  inner-membrane translocator  52.77 
 
 
432 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0294361  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  45.12 
 
 
404 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  46.41 
 
 
405 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  43.19 
 
 
390 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  43.23 
 
 
410 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  40.93 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  41.18 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  40.94 
 
 
388 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  37.78 
 
 
396 aa  220  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  40.1 
 
 
373 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  40.33 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 
399 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
397 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  37.82 
 
 
394 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  37.82 
 
 
394 aa  206  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  37.82 
 
 
394 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  40.62 
 
 
399 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  40.62 
 
 
399 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  37.73 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
381 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  39.61 
 
 
403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.37 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  37.03 
 
 
389 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
400 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
400 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  38.56 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  37.76 
 
 
393 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  36.72 
 
 
376 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  37.76 
 
 
393 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  38.56 
 
 
399 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  38.62 
 
 
399 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  38.82 
 
 
405 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  37.57 
 
 
393 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  37.21 
 
 
393 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  37.21 
 
 
393 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
393 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  38.17 
 
 
394 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  37.53 
 
 
399 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 
378 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
432 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
390 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 
427 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  42.15 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
378 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  33.88 
 
 
444 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
432 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  33.97 
 
 
432 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  33.25 
 
 
437 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  33.41 
 
 
435 aa  177  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.88 
 
 
389 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
428 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
396 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>