More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2619 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 399 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  97.99 
 
 		 399 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  85.21 
 
 		 398 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  83.42 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  83.17 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  83.17 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  83.04 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  78.75 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  82.46 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  86.05 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  78.75 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  84.66 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  69.5 
 
 		 378 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  69.23 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  70.56 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  63.47 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  61.69 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  61.69 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  60.31 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  59.01 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  62.12 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  59.27 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  53.46 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  53.19 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  53.46 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  52.53 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  52.07 
 
 		 376 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  51.26 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  51.26 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  54.2 
 
 		 394 aa  362  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 397 aa  358  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  54.64 
 
 		 394 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  54.16 
 
 		 390 aa  349  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  51.96 
 
 		 393 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  53.41 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  48.41 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  52.06 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.06 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.06 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.06 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  52.06 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.06 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  51.8 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  52.06 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  51.8 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  46.83 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  47.28 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.64 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  38.08 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3198  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 414 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.126152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  38.63 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.26 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  37 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.58 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0739  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  39.44 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  35.36 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  36.6 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  39.12 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  37.01 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  36.36 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  37.83 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.68 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  38.9 
 
 		 406 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1047  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2252  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  37.97 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4717  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1866  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0645389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2944  Monosaccharide-transporting ATPase  38.2 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293964  normal  0.495103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>