More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3113 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3113  inner-membrane translocator  100 
 
 		 437 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.645278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4466  inner-membrane translocator  68.05 
 
 		 444 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1211  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  67.28 
 
 		 437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3186  inner-membrane translocator  65.9 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2926  inner-membrane translocator  65.68 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.519416 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  54.94 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  51.75 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  52.21 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2618  inner-membrane translocator  52.45 
 
 		 432 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40748  normal  0.342974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1752  inner-membrane translocator  50.24 
 
 		 406 aa  328  8e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.090223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2702  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5023  inner-membrane translocator  44.85 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  41.48 
 
 		 373 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  37.53 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 		 376 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  36 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  34.33 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  34.33 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  34.33 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  35.7 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  36.26 
 
 		 394 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  35.75 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  37.56 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  36.41 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.54 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  33.9 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  35.51 
 
 		 399 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0613  monosaccharide-transporting ATPase  35.7 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  33.49 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  34.52 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0385  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  35.38 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  35.38 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 393 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  35.14 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  34.12 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  35.14 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 369 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2578  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.270566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0228  monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1668  monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 		 390 aa  174  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.120598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1587  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 392 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2684  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  36.28 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3661  monosaccharide-transporting ATPase  34.33 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.76 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4475  monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 		 404 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.826899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0753  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2518  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  33.51 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  36.22 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1985  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.46 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1180  Monosaccharide-transporting ATPase  32.85 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>