More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6739 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  100 
 
 		 415 aa  786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  70.71 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  73.43 
 
 		 417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  70.95 
 
 		 420 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  66.91 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  54.29 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  53.51 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5346  inner-membrane translocator  52.43 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2672  inner-membrane translocator  52.96 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00233752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  50.48 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 478 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  51.85 
 
 		 449 aa  312  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  48.34 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 411 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  43.95 
 
 		 444 aa  300  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1505  inner-membrane translocator  50.22 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  43.77 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  43 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  40 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  40.88 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  39.9 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  39.59 
 
 		 496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4210  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  40.3 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  36.75 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2814  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.997066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0242  sugar ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0267  sugar ABC transporter, permease protein  39.85 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0347113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0843  inner-membrane translocator  40.16 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  38.38 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4283  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  34.28 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  34.79 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  37.64 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  36.41 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  36.41 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  36.41 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3838  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.660821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27970  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.51 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  34.08 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  36.24 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0107  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  36.24 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6622  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 369 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790892 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3416  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00105488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  33.76 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  33.17 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2891  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  30.47 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1635  xylose transmembrane ABC transporter protein  38.24 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0935  sugar ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.968429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2619  ABC D-xylose transporter, inner membrane subunit  35.83 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2139  putative L-arabinose transport system permease protein araH  32.05 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0877  sugar ABC transporter, permease protein  31.28 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  34.73 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0840  inner-membrane translocator  30.02 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229373  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2841  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2339  monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138041  normal  0.022566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0240  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0784827  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1179  ABC sugar (xylose) transporter, inner membrane subunit  31.85 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3175  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235979  normal  0.918158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3005  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6630  Monosaccharide-transporting ATPase  35.2 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2300  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3906  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.24 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  29.27 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2886  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120464  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1999  xylose transport system permease protein  31.34 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222102  normal  0.247707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>