More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1275 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 374 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  80.91 
 
 		 373 aa  604  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  73.94 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  60.32 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  55.68 
 
 		 385 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 		 385 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  54.47 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  53.78 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  53.78 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  53.78 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  53.78 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  53.78 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  53.78 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  53.89 
 
 		 374 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  49.73 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  49.45 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  48.63 
 
 		 376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  49.18 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  49.18 
 
 		 373 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  45.89 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  42.97 
 
 		 344 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 344 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  39.62 
 
 		 346 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  37.17 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  38.86 
 
 		 377 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 352 aa  196  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.72 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 353 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3403  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 317 aa  126  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2747  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1861  xylose ABC transporter permease  29.03 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0485128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  32.28 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  28.61 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.14 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  31.35 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.43 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  33.53 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  33.75 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0406  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.335145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  27.84 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.33 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0504  Monosaccharide-transporting ATPase  30.92 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3267  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322146  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0883  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 316 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.13 
 
 		 327 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  30.96 
 
 		 324 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  31.9 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2513  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  30.7 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4777  Monosaccharide-transporting ATPase  28.99 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2912  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116339  normal  0.80082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>