More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3147 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  100 
 
 		 327 aa  617  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  99.69 
 
 		 327 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  52.78 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  52.78 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  52.78 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  52.78 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  52.78 
 
 		 332 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  55.45 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  55.45 
 
 		 330 aa  315  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  55.45 
 
 		 330 aa  315  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  55.45 
 
 		 330 aa  315  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  52.83 
 
 		 333 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  52.83 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  55.14 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  52.52 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  49.83 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  54.04 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  44.48 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  44.48 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  44.48 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  44.48 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.83 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  42.72 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  54.9 
 
 		 265 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.92 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  36.79 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  46.5 
 
 		 215 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  45.5 
 
 		 220 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  35.65 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.33 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.4 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1365  monosaccharide-transporting ATPase  36.5 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925681  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  34.12 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.07 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.78 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.8 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.8 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.03 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.03 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>