More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2597 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  100 
 
 
330 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  83.74 
 
 
328 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  74.01 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  74.38 
 
 
337 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  74.25 
 
 
334 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  75.5 
 
 
335 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  75.17 
 
 
335 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  65.26 
 
 
334 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  51.78 
 
 
327 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  52.75 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  44.98 
 
 
318 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 
342 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  41.46 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.75 
 
 
338 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 
333 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 
338 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 
338 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
317 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 
337 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
336 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  41.22 
 
 
322 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  39.04 
 
 
331 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
316 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.52 
 
 
312 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  34.25 
 
 
337 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.3 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.65 
 
 
333 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 
337 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.13 
 
 
333 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
336 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.73 
 
 
348 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
334 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
334 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 
333 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 
334 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  36.89 
 
 
329 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
315 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.14 
 
 
331 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
330 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  34.33 
 
 
337 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
330 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 
330 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  37.06 
 
 
330 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.53 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.13 
 
 
337 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
334 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 
306 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
337 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
309 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  30.75 
 
 
320 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  37.32 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.04 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 
332 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
325 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
310 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.52 
 
 
324 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 
328 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  31.95 
 
 
322 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  31.5 
 
 
334 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.22 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.68 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.68 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.17 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.68 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.68 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  35.52 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.87 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  30.33 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  30.42 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  31.08 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.68 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  29.41 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  34.45 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 
311 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  32.22 
 
 
332 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  37.97 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  37.97 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  37.97 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  31.95 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  32.2 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.96 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.65 
 
 
342 aa  139  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 
345 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>