More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5277 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
337 aa  648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  47.53 
 
 
333 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  42.47 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  50.48 
 
 
329 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  42.5 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  46.04 
 
 
338 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.04 
 
 
338 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  45.48 
 
 
331 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  47.37 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  38.68 
 
 
336 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  44.57 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  36.36 
 
 
328 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  36.83 
 
 
337 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
337 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 
332 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
330 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 
337 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
334 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 
327 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 
337 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  42.04 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.74 
 
 
317 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
311 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
322 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  38.89 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  38.34 
 
 
334 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
331 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.43 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.43 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.43 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.43 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.43 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
322 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  30.89 
 
 
338 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.03 
 
 
348 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 
334 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  30.4 
 
 
315 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.29 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
329 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.3 
 
 
350 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  32.67 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
329 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  31.31 
 
 
338 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  31.42 
 
 
329 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 
331 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  31.31 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  31.02 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  31.69 
 
 
334 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 
339 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  32.69 
 
 
338 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2600  L-arabinose transporter permease protein  33.23 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860073  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  33.56 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  33.56 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  33.56 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  30.06 
 
 
348 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  29.05 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.22 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  29.05 
 
 
333 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  33.54 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.83 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  33.54 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  29.05 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.41 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  32.38 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  31.06 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  34.28 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  32.03 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  36.1 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.46 
 
 
327 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  32.31 
 
 
316 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 
320 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
309 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  32.99 
 
 
316 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  35.51 
 
 
330 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  33.58 
 
 
349 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.34 
 
 
325 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  33.58 
 
 
349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  33.58 
 
 
349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.11 
 
 
325 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.46 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>