More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3568 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
332 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  75.3 
 
 
333 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  75.3 
 
 
333 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6268  ABC transporter membrane spanning protein  74.77 
 
 
333 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  67.9 
 
 
326 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  62.31 
 
 
334 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  62.27 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  63.58 
 
 
325 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  52.31 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  51.41 
 
 
356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  43.45 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 
331 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  41.19 
 
 
339 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  36.17 
 
 
341 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 
317 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  39.59 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  38.71 
 
 
317 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  32.1 
 
 
333 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.16 
 
 
333 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
352 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 
333 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  37.35 
 
 
330 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.83 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.28 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  39.04 
 
 
334 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 
350 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.54 
 
 
320 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  36.93 
 
 
324 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  37.82 
 
 
861 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  35.93 
 
 
352 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  35.51 
 
 
335 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  35.58 
 
 
351 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 
351 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  35.51 
 
 
335 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.74 
 
 
342 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 
348 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.46 
 
 
310 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  34.18 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  35.28 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.46 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.87 
 
 
338 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  35.06 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.76 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
835 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 
324 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.17 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  34.48 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.27 
 
 
322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  35.8 
 
 
348 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
354 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
311 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.53 
 
 
311 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.53 
 
 
311 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
311 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  34.63 
 
 
315 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
331 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
311 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
311 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.32 
 
 
311 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 
317 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
334 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
334 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 
311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  40.59 
 
 
340 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.06 
 
 
334 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  36.03 
 
 
317 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
317 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.65 
 
 
322 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 
313 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.42 
 
 
322 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.87 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  35.69 
 
 
317 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  33.76 
 
 
338 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.87 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  35.69 
 
 
317 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 
336 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.62 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.87 
 
 
324 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
341 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  33.87 
 
 
306 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
339 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 
359 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 
333 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
324 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 
325 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 
322 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.63 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.84 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>