More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3042 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 340 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2303  inner-membrane translocator  61.2 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  52.81 
 
 		 348 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  51.56 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  52.19 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  52.84 
 
 		 353 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  51.88 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  43.11 
 
 		 861 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  53.18 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5276  Monosaccharide-transporting ATPase  50.61 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  39.62 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  40.27 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  40.88 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 333 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.35 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  42.26 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  37.22 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.64 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 		 326 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.28 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  36.64 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  36.64 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2726  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.54 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  36.64 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  36.3 
 
 		 317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  38.49 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.56 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  37.69 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  34.67 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  37.58 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.25 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.94 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  34.37 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  34.06 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.73 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  30.25 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.82 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  34.3 
 
 		 318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  36.59 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  36.59 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>