More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2303 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2303  inner-membrane translocator  100 
 
 		 340 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  56.88 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  61.2 
 
 		 340 aa  288  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  58.41 
 
 		 363 aa  275  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  49.85 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.83 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  51.59 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  51.35 
 
 		 353 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  47.21 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  45.45 
 
 		 861 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5276  Monosaccharide-transporting ATPase  48.63 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  37.34 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  36.08 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  36.08 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  36.08 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  36.08 
 
 		 317 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  38.57 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  35.41 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  36.3 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.54 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  39.62 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  34.62 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  34.29 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  36.18 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2132  Monosaccharide-transporting ATPase  37.71 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.56 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.06 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  41.39 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2127  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  37.89 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4321  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  36.22 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  36.22 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  36.22 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4291  inner membrane ABC transporter permease YdeY  36.22 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4404  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  36.22 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.72 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.39 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.93 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1658  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  37.04 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2144  monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.69 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1596  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  37.04 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  37.24 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  31.45 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  30.87 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.11 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  30.74 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30.74 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>