More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0882 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
363 aa  673    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  54.12 
 
 
339 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2303  inner-membrane translocator  58.41 
 
 
340 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  45.77 
 
 
341 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  53.18 
 
 
340 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 
352 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  44.79 
 
 
353 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  45.85 
 
 
348 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5276  Monosaccharide-transporting ATPase  49.52 
 
 
351 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  35.96 
 
 
317 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.56 
 
 
861 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
334 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 
335 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  42.12 
 
 
343 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 
317 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
317 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  34.15 
 
 
317 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  38.3 
 
 
327 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
317 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  34.15 
 
 
317 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  34.15 
 
 
317 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  34.15 
 
 
317 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 
336 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
317 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  36.3 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.19 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  33.22 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  32.36 
 
 
351 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.52 
 
 
309 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
334 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.38 
 
 
314 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  38.56 
 
 
325 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  32.04 
 
 
351 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 
351 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2726  monosaccharide-transporting ATPase  41.36 
 
 
340 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
331 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2190  Monosaccharide-transporting ATPase  39.5 
 
 
343 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
311 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 
350 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
310 aa  152  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.2 
 
 
336 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
326 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 
341 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 
333 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
333 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 
334 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  37.74 
 
 
356 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.38 
 
 
310 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.7 
 
 
310 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 
334 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
324 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  32.92 
 
 
338 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 
334 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.25 
 
 
342 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  31.86 
 
 
347 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  31.8 
 
 
337 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4404  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  33.54 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  31.29 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4321  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  33.54 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  33.23 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  38.21 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.45 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4291  inner membrane ABC transporter permease YdeY  33.23 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2144  monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 
835 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1596  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  32.02 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2132  Monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 
342 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
340 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 
363 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.37 
 
 
334 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  31.51 
 
 
333 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.79 
 
 
312 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.99 
 
 
348 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.9 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.9 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  34.67 
 
 
330 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
330 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.13 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
330 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  35.74 
 
 
344 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  35.74 
 
 
344 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 
311 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.49 
 
 
338 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2127  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  31.74 
 
 
342 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
331 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1658  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  31.74 
 
 
342 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 
345 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
311 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>