More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2190 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2190  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 343 aa  649    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2983  monosaccharide-transporting ATPase  59.4 
 
 		 352 aa  318  9e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0403702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.19 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.19 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.51 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.51 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.96 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  33.11 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  35.26 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.58 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.08 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.72 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.27 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.17 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  35.68 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.17 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.81 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  38.84 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.84 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  38.07 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  37.68 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  33.11 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  34.14 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 835 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.53 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  37.08 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.53 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  32.77 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  32.77 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  32.77 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.84 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  38.84 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.84 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  38.84 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  35.21 
 
 		 861 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.04 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  39.3 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  39.3 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.17 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  33.12 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.72 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.53 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>