More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3462 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 353 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  86.97 
 
 		 352 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  86.69 
 
 		 352 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  81.58 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  56.6 
 
 		 341 aa  341  9e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2303  inner-membrane translocator  51.35 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  51.1 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  44.83 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  38.49 
 
 		 861 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  44.79 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5276  Monosaccharide-transporting ATPase  45.12 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  38.01 
 
 		 327 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  41.59 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  34.92 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  35.19 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 		 315 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0392  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  33.65 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  33.65 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6268  ABC transporter membrane spanning protein  37.46 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 317 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.83 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.97 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2726  monosaccharide-transporting ATPase  38.67 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.3 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2190  Monosaccharide-transporting ATPase  37.66 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.19 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.22 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.19 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  35.07 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.11 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3074  monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  30.03 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.78 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  30.03 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 		 835 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.45 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  32.67 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>