More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2726 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2726  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 340 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  85.34 
 
 		 343 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  42.75 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  35.94 
 
 		 861 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  42.18 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  38.84 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  37.75 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  38.28 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  38.28 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  38.98 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.03 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  33.13 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  33.13 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  33.13 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.36 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.36 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  36.18 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  32.83 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.71 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  32.83 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.83 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  34.05 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.71 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.44 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.56 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.37 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  35.03 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.44 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.49 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.37 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  32.82 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  31.77 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  33.44 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  31.01 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5276  Monosaccharide-transporting ATPase  41.77 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>