More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4262 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 336 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  88.69 
 
 		 334 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  88.69 
 
 		 334 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3407  monosaccharide-transporting ATPase  77.48 
 
 		 333 aa  491  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0543  ribose ABC transporter, permease protein  80.37 
 
 		 333 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0696377  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0545  ribose ABC transporter, permease protein  80.37 
 
 		 333 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5264  monosaccharide-transporting ATPase  57.99 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3674  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.87 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765342  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0963  Monosaccharide-transporting ATPase  52.27 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  52.7 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  48.19 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  50.48 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2908  inner-membrane translocator  50 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3273  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6150  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2684  monosaccharide-transporting ATPase  51.11 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2824  inner-membrane translocator  52.44 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1488  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.9 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.16 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.42 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.42 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.42 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.1 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.1 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.39 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.38 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  42.12 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.95 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.82 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.25 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.31 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.13 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.01 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.23 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.6 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.37 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.08 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.26 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.17 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  35.38 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.06 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  32.82 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.82 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  35.08 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.12 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  34.46 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  34.46 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  34.46 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  34.46 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  34.46 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.38 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>