More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3605 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  90 
 
 		 330 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3074  monosaccharide-transporting ATPase  87.27 
 
 		 329 aa  547  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  72.67 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  67.74 
 
 		 331 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 329 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  45.31 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0392  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.2 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.99 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.99 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.6 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.99 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.99 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.84 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.23 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.51 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.29 
 
 		 835 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  36.66 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  36.66 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  37.77 
 
 		 365 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.27 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  37.71 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.96 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.19 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.42 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  35.2 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  34.6 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  37.67 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.06 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  37.67 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  34.35 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.77 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  38.2 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  33.03 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  33.03 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.86 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>