More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3651 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  99.15 
 
 		 351 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  98.29 
 
 		 351 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 351 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1596  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  76 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2144  monosaccharide-transporting ATPase  76 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2132  Monosaccharide-transporting ATPase  75.71 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4404  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  74.79 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2127  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  75.71 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  74.79 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1658  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  75.43 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4321  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  74.79 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  74.5 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4291  inner membrane ABC transporter permease YdeY  74.43 
 
 		 346 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  65.27 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  68.94 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  44.95 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  45.18 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  43.65 
 
 		 317 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  43.65 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 317 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  44 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  44 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3502  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.76 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3148  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  36.7 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  33.73 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.35 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.23 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.41 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  39.34 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  34.57 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  31.89 
 
 		 861 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.83 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 353 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 		 354 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.37 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  29.41 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  29.25 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.67 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.23 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2726  monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 		 835 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  29.7 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.21 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.41 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  29.37 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  30.18 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  29.7 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>