More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4072 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  100 
 
 
334 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  63.93 
 
 
332 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  59.27 
 
 
333 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  59.27 
 
 
333 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  61.3 
 
 
327 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6268  ABC transporter membrane spanning protein  60.66 
 
 
333 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  57.5 
 
 
325 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  58.15 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  50.32 
 
 
343 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  47.32 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  44.48 
 
 
335 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
341 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.13 
 
 
861 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  33.03 
 
 
333 aa  185  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
352 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 
352 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
324 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  38.27 
 
 
353 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
310 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
311 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40 
 
 
835 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.13 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.13 
 
 
310 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
316 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 
317 aa  165  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  34.21 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  38.05 
 
 
339 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 
333 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  37.25 
 
 
330 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 
324 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 
348 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.97 
 
 
322 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  35.79 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
317 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 
350 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  34.07 
 
 
322 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  33.02 
 
 
317 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  35.79 
 
 
317 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  35.79 
 
 
317 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  35.45 
 
 
317 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  34.07 
 
 
322 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.49 
 
 
331 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.11 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
333 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  34.08 
 
 
321 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
341 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 
322 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.64 
 
 
336 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.89 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  36.03 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.95 
 
 
311 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
324 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.95 
 
 
311 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
325 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.6 
 
 
322 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 
354 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 
340 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.29 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
350 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 
317 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.29 
 
 
327 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.65 
 
 
324 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 
317 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 
363 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
320 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 
348 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  34.07 
 
 
328 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
334 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.3 
 
 
311 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
334 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.3 
 
 
311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 
311 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 
311 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
331 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.83 
 
 
323 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  30.69 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>