More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2210 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 343 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  71.73 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  51.52 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  51.21 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  52.77 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  49.39 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  49.67 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  47.63 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  48.43 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6268  ABC transporter membrane spanning protein  52.87 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.97 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.97 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  37.09 
 
 		 861 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.13 
 
 		 835 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.05 
 
 		 352 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  39.6 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  35.17 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  36.77 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  35.6 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  34.48 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  34.48 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  34.48 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  34.14 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  35.18 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.87 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  41.34 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.25 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  33.98 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.1 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  37.09 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.25 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.87 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.91 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.91 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  36.04 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.9 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  38.24 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.16 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.46 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.46 
 
 		 334 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  36.21 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  35.81 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  31.23 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  31.23 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.35 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  33.66 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  36.88 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  36.88 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.45 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  36.42 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  36.81 
 
 		 279 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.1 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.56 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.42 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.56 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>