More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2121 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  100 
 
 		 356 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  72.39 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  50.94 
 
 		 333 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  50.31 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  52 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  49.15 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  50.63 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  47.32 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  47.68 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6268  ABC transporter membrane spanning protein  50.94 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  37.84 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  35.24 
 
 		 861 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 		 835 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.74 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.74 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 		 331 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  39.51 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  30.65 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  35.44 
 
 		 348 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  31.02 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  34.62 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.63 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  36.57 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  35.52 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  35.52 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  35.52 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  35.17 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  38.07 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.27 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 325 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.48 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.27 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 322 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.9 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.9 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  33.9 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  30.12 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.58 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.58 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.89 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.82 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.96 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.05 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.44 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.44 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3273  putative ABC transporter, permease protein,y4mJ-like protein  36.79 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.715289  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>