More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0227 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  69.54 
 
 		 325 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  67.9 
 
 		 327 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  68.65 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  63.89 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  63.89 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6268  ABC transporter membrane spanning protein  67.59 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  58.15 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  50.63 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  44.09 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2210  monosaccharide-transporting ATPase  48.43 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.235033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  34.25 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  41.51 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.95 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  35.62 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  35.53 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  35.31 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.09 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  39.8 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.8 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  35.19 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.31 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  36.71 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.89 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  34.78 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.92 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  35.66 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  31.9 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.8 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  38.22 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.13 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  35.65 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 835 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.31 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  33.23 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  33.23 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.13 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.88 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.88 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.06 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.99 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.22 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.22 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  34.04 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.03 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.03 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.02 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  32.93 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  30.49 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.24 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>