More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2460 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  100 
 
 		 333 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  56.79 
 
 		 342 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  57.42 
 
 		 333 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  60.06 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  60.06 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  52.57 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  53.44 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  47.53 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  44.55 
 
 		 318 aa  242  7.999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  42.09 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  41.53 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  48.55 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 330 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  42.95 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  46.51 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 317 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  40.37 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  40.25 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  40.94 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  42.32 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.09 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.13 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.13 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33.54 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  33.23 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.22 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.22 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.22 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.22 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.22 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  32.39 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  33.55 
 
 		 338 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  33.55 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  34.77 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.32 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.42 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  33.23 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  37 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.89 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  34.89 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  34.89 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.93 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  34.67 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  34.58 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  36.71 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  34.67 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  34.67 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 343 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.46 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  32.91 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  33.66 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  37.09 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 337 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.88 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  35.36 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.01 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.3 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  37.97 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  37.97 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  35.13 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>