More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0228 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 334 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  76.92 
 
 		 328 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  74.25 
 
 		 330 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  75.23 
 
 		 337 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  72.14 
 
 		 332 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  74.5 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  74.5 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  64.86 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  50.5 
 
 		 327 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  51.03 
 
 		 320 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  44.76 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  42.44 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  40.8 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.06 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  41.19 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.65 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  38.73 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.19 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.85 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.15 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.15 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  38.51 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36.97 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  37.84 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  33.13 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  34.76 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  34.76 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.08 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.08 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  37.79 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  34.45 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  38.34 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.73 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  35.56 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  36.42 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  32.31 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.19 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  36.42 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.91 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  37.42 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  37.42 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  34.44 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  37.42 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.17 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  33.44 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  38.24 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  38.24 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  35.71 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  33.44 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.12 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  35.71 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  35.71 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  35.71 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>