More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2727 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 337 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  82.2 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  42.17 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  40.37 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 		 342 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  42.19 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  40.19 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.53 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  38.54 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  39.57 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  35.85 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  42.6 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.62 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  37.76 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 352 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.55 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  32.55 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.1 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.84 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.49 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.49 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  36.54 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.49 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  36.3 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.05 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.15 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.05 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.97 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2687  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.97 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.21 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.57 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.57 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.01 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.57 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.57 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.57 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  34.85 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.15 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.05 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  34.04 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.21 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  35.97 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  35.97 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.55 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  35.71 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>