More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2400 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 334 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  61.51 
 
 		 326 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  62.38 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3127  monosaccharide-transporting ATPase  58.33 
 
 		 324 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  50.5 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  52.6 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  53.61 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  46.58 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.88 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  47.56 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  48.3 
 
 		 835 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  45.02 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.79 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  47.19 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  46.86 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  46.86 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  46.86 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  44.01 
 
 		 342 aa  218  8.999999999999998e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  44.52 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.64 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.64 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  46.53 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.64 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  46.18 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  45 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  47.04 
 
 		 311 aa  212  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  46.56 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  44.74 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  45.48 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  41.21 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  46.23 
 
 		 350 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  40.76 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  42.73 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  44.82 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  44.52 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  41.94 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.41 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.71 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.12 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.72 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  44.55 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  41.97 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  43.51 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.71 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  44.74 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.71 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  48.29 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  41.45 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  39.27 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 348 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  41.19 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  41.06 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  41.57 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  43.67 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  43.05 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  41.16 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  41.04 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.28 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  43.19 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 315 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  41.32 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  42.39 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  43.67 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.06 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  41.38 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>