More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1858 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
324 aa  633    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  43.93 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0963  Monosaccharide-transporting ATPase  44.76 
 
 
337 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  45.08 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3674  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 
337 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765342  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  45.81 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  44.52 
 
 
311 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  43.38 
 
 
311 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.72 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.05 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
311 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  46.75 
 
 
310 aa  220  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.72 
 
 
311 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.4 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.72 
 
 
311 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.72 
 
 
311 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.58 
 
 
310 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.61 
 
 
324 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  43.24 
 
 
310 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3273  inner-membrane translocator  43.87 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449838  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  43.24 
 
 
835 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2908  inner-membrane translocator  40.19 
 
 
330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.57 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1488  inner-membrane translocator  41.14 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.58 
 
 
306 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 
350 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  41.59 
 
 
332 aa  208  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2684  monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 
330 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  44.26 
 
 
322 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  42.61 
 
 
323 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.69 
 
 
334 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  43.75 
 
 
327 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  42.47 
 
 
313 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6150  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  39.87 
 
 
330 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.25 
 
 
324 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  43.42 
 
 
327 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 
334 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 
334 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  40.26 
 
 
322 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  42.91 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  44.37 
 
 
314 aa  199  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  41.23 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  41.07 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.6 
 
 
322 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  39.4 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 
327 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  40.76 
 
 
327 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
314 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  42.72 
 
 
334 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  40.76 
 
 
326 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
342 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.68 
 
 
309 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  39.25 
 
 
322 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  39.67 
 
 
320 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  40.48 
 
 
336 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  40 
 
 
315 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.72 
 
 
334 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  42.7 
 
 
308 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.38 
 
 
342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.33 
 
 
316 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  39.12 
 
 
334 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  41.64 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.39 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  41.11 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.47 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  40.58 
 
 
321 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
325 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  40.58 
 
 
322 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  38.72 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.54 
 
 
317 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  40.72 
 
 
342 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  40.5 
 
 
325 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  41.39 
 
 
321 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  41.39 
 
 
321 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
325 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  41.39 
 
 
321 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  41.39 
 
 
321 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  41.39 
 
 
321 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.2 
 
 
348 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  37.91 
 
 
346 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
306 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  38.04 
 
 
298 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 
294 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  37.73 
 
 
294 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  37.99 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  41.36 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  40.38 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  39.53 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 
333 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>