More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0883 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
341 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  51.32 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  53.75 
 
 
329 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  52.63 
 
 
352 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
333 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  46.86 
 
 
333 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  51.5 
 
 
338 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  47.37 
 
 
337 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.38 
 
 
338 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  46.06 
 
 
342 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 
318 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  42.6 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 
332 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  52.1 
 
 
322 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  36.94 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  36.28 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  40.43 
 
 
337 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 
327 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  35.27 
 
 
333 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.78 
 
 
334 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  34.93 
 
 
333 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  34.93 
 
 
333 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.23 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.45 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.43 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.23 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.23 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.45 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.93 
 
 
332 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 
338 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  31.3 
 
 
345 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
311 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
311 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  34.41 
 
 
321 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.19 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 
337 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.87 
 
 
311 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 
311 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 
335 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  36.49 
 
 
335 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
311 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  32.54 
 
 
326 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  34.71 
 
 
358 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.55 
 
 
311 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.55 
 
 
311 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
337 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  38.98 
 
 
334 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.46 
 
 
338 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 
343 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  33.96 
 
 
349 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  34.28 
 
 
349 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  36.62 
 
 
328 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  32.13 
 
 
335 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.9 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  37.87 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  32 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  34.04 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  34.04 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
332 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
332 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 
333 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  33.21 
 
 
337 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
310 aa  133  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  34.54 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  36.2 
 
 
330 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  31.8 
 
 
333 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  33.86 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  35.34 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  33.86 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  34.18 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>