More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1227 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  100 
 
 		 349 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  99.71 
 
 		 349 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  95.04 
 
 		 343 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  87.13 
 
 		 343 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  88.89 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  88.89 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  88.6 
 
 		 343 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  74.46 
 
 		 327 aa  457  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  69.28 
 
 		 345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  69.34 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  43.6 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  43.6 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  43.6 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  50.17 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  45.65 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  43.16 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 345 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 345 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  43.48 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  50.34 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  48.78 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  44.72 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  45.07 
 
 		 327 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  42.14 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.22 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  44.1 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  44.1 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  44.1 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  44.1 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  44.1 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  44.1 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  44.1 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  43.4 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  44.1 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  42.52 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  43.69 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  43.67 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  42.77 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  42.55 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  46.06 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.99 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.05 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.84 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  47.59 
 
 		 276 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  43.71 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  43.16 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  44.23 
 
 		 310 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  42.94 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.95 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.23 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  44.28 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  40.23 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  40.98 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  42.65 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  42.94 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.95 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  43.45 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  43.45 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  44.88 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  44.54 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.94 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.06 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  44.14 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  42.2 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.74 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  43.28 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 		 835 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  38.15 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  42.33 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  41.87 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>