More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0053 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  100 
 
 		 327 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  68.73 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  68.73 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  68.73 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  68.42 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  68.42 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  63.27 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  63.58 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  63.58 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  65.94 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  65.94 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  65.62 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  65.94 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  65.94 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  61.56 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0938671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  66.14 
 
 		 265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  49.83 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  45.48 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  44.52 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  44.52 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  44.52 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  44.52 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  44.52 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  44.03 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 		 220 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  46.57 
 
 		 215 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1715  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD, truncation  70.09 
 
 		 114 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.78 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  30.92 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  30.28 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  31.58 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  30.98 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  29.57 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.66 
 
 		 346 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  28.89 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.4 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.4 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  33.61 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.77 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.29 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.4 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.1 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.06 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.32 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.88 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  31.12 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  30.22 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.65 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  30.14 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  31.1 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.1 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.31 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  28.99 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  29.37 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  29.93 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.42 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  31.68 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.97 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  29.32 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>