More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3701 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  100 
 
 
352 aa  670    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  53.56 
 
 
341 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  53.09 
 
 
329 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  46.25 
 
 
342 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  45.97 
 
 
333 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  50.92 
 
 
338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  45.59 
 
 
333 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
331 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.18 
 
 
338 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  44.57 
 
 
337 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  42.01 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 
337 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  42.65 
 
 
336 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  41.24 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  41.34 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 
332 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
337 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  36.5 
 
 
337 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.51 
 
 
338 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  39.76 
 
 
334 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  46.25 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  39.92 
 
 
327 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  34.54 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  34.54 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  34.54 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  34.54 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  34.54 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  30.09 
 
 
338 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  29.8 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
347 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  34.85 
 
 
328 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
329 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
333 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33 
 
 
333 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  30.77 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  33 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  29.8 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
324 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 
348 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.03 
 
 
334 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  34.41 
 
 
327 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.73 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 
312 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  32.06 
 
 
324 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  37.35 
 
 
320 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  33.22 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.5 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  32.52 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.74 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.36 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.16 
 
 
345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 
345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.16 
 
 
345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.9 
 
 
347 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.98 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.98 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  38.41 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  30.79 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.16 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  31.76 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  31.76 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.98 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  31.76 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  32.6 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  31.76 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  31.45 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  37.16 
 
 
335 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 
333 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  31.45 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 
329 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  31.76 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  32.25 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
326 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
314 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  31.53 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  35.85 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  33.78 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.25 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  30.48 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>