More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0623 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  98.52 
 
 
338 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  100 
 
 
338 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  100 
 
 
338 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  98.22 
 
 
338 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  99.7 
 
 
338 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  97.93 
 
 
338 aa  630  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  97.93 
 
 
338 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  90.83 
 
 
338 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  90.53 
 
 
338 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  90.24 
 
 
338 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  89.64 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  88.46 
 
 
334 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  69.53 
 
 
335 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  73.25 
 
 
335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  72.61 
 
 
335 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  71.7 
 
 
315 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  64.45 
 
 
316 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  64.12 
 
 
317 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  63.46 
 
 
316 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
328 aa  335  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
328 aa  335  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
328 aa  335  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  57.76 
 
 
329 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  57.76 
 
 
329 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  57.76 
 
 
328 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
328 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
328 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 
327 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  57.43 
 
 
349 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  58.28 
 
 
329 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  57.43 
 
 
349 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  57.1 
 
 
349 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  57.76 
 
 
326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  57.24 
 
 
329 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  55.63 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  56.03 
 
 
328 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  55.45 
 
 
328 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  52.62 
 
 
339 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  53.12 
 
 
322 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  51.69 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  51.99 
 
 
341 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  51.69 
 
 
339 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  51.99 
 
 
341 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  54.15 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  51.99 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  48.47 
 
 
334 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  50.65 
 
 
338 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  50.95 
 
 
339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0047  L-arabinose transporter permease protein  52.31 
 
 
339 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149615  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  52.19 
 
 
333 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2600  L-arabinose transporter permease protein  47.15 
 
 
336 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3010  L-arabinose transporter permease protein  47.15 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  41.95 
 
 
315 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.78 
 
 
330 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 
330 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 
306 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.15 
 
 
309 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
330 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.49 
 
 
322 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
314 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.26 
 
 
323 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.76 
 
 
324 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.18 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  40.56 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.83 
 
 
327 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.51 
 
 
327 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  39.09 
 
 
310 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.06 
 
 
324 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.42 
 
 
348 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.15 
 
 
333 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 
333 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 
311 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 
309 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
314 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
311 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  34.2 
 
 
318 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.64 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.29 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.13 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.13 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.09 
 
 
324 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 
350 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.78 
 
 
331 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.63 
 
 
336 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 
313 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 
331 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 
311 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.74 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.57 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>