More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4321 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4291  inner membrane ABC transporter permease YdeY  99.42 
 
 
346 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4404  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  100 
 
 
347 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  99.71 
 
 
347 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4321  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  100 
 
 
347 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  99.42 
 
 
347 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2132  Monosaccharide-transporting ATPase  83.86 
 
 
342 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2127  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  83.29 
 
 
342 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1596  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  83.29 
 
 
342 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1658  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  83.29 
 
 
342 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2144  monosaccharide-transporting ATPase  83.29 
 
 
342 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  74.79 
 
 
351 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  75.07 
 
 
351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  74.14 
 
 
351 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  62.99 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  66.18 
 
 
343 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  45.67 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  46.67 
 
 
317 aa  255  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  46.67 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  48.94 
 
 
317 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  48.94 
 
 
317 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  48.94 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  47.89 
 
 
317 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3502  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.96 
 
 
336 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  47.89 
 
 
317 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  46 
 
 
322 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 
317 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3148  inner-membrane translocator  50.64 
 
 
336 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  38.03 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
341 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
317 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
314 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
309 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
317 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 
333 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 
315 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 
317 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
352 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 
363 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  35.23 
 
 
327 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  32.54 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.56 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
311 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 
354 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 
350 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  32.15 
 
 
334 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
352 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 
336 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  33.98 
 
 
861 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.63 
 
 
312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.82 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
365 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.23 
 
 
324 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.18 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  32.84 
 
 
355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  36.91 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 
348 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 
322 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
333 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
355 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
346 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  34.41 
 
 
318 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
311 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  32.91 
 
 
316 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
311 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 
324 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
325 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 
353 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 
331 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  34.41 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  31.6 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.67 
 
 
311 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  33.97 
 
 
332 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  32.92 
 
 
329 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  31.68 
 
 
324 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  33.88 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.67 
 
 
311 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.67 
 
 
311 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
363 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33.88 
 
 
335 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>