More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0371 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  100 
 
 		 338 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  71.95 
 
 		 330 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  72.67 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3074  monosaccharide-transporting ATPase  69.91 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  65.16 
 
 		 331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  47.28 
 
 		 328 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0392  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.34 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.48 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 		 835 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.16 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  35.31 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.2 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  39.43 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.56 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.81 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.56 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.48 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.24 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.41 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.24 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.83 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.83 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  37.79 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  33.75 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.14 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.85 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  37.93 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  38.3 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.22 
 
 		 327 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.32 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.22 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  37.1 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.67 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  34.08 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  36.05 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.06 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  38.01 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.52 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.1 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.1 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  38.75 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  38.75 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>