More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3534 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  69.51 
 
 
333 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  69.51 
 
 
333 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  67.28 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  67.28 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  67.28 
 
 
332 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  69.21 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  66.98 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  67.28 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  69.85 
 
 
330 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  69.54 
 
 
330 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  69.85 
 
 
330 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  69.85 
 
 
330 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  69.85 
 
 
330 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  61.56 
 
 
327 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  67.45 
 
 
265 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  54.04 
 
 
327 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  54.04 
 
 
327 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 
329 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  43.69 
 
 
338 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  43.69 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  43.69 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  43.51 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
329 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  42.9 
 
 
329 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  38.27 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.63 
 
 
220 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 
338 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  43.63 
 
 
215 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1715  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD, truncation  70.27 
 
 
114 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
322 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  35.17 
 
 
333 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 
318 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.7 
 
 
314 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 
333 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  32.48 
 
 
328 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.79 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  31.55 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  34.08 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
330 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 
346 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
346 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 
338 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  36.09 
 
 
334 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.74 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  31.89 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.2 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  28.15 
 
 
323 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  35.8 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  32.33 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
327 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  30.48 
 
 
309 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.04 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  29.48 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  32.26 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  30.35 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.53 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.31 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  30.58 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.31 
 
 
311 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.31 
 
 
311 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.31 
 
 
311 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
353 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 
353 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.57 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  30.72 
 
 
360 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  33.69 
 
 
849 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 
328 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 
337 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  32.34 
 
 
336 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.35 
 
 
345 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30 
 
 
345 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30.33 
 
 
347 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.61 
 
 
323 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  31.89 
 
 
341 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  29.79 
 
 
355 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
326 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 
311 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
341 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.18 
 
 
309 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 
334 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.35 
 
 
345 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.35 
 
 
345 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  27.51 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>