More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01472 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  100 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  100 
 
 		 330 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  99.61 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  99.61 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  83.46 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  83.46 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  83.46 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  83.46 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  83.07 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  78.91 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  78.52 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  78.91 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  66.14 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  67.45 
 
 		 327 aa  284  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  54.9 
 
 		 327 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  54.51 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1715  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD, truncation  100 
 
 		 114 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  40.16 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  40.16 
 
 		 338 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  40.16 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  40.16 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  40.78 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  42.13 
 
 		 220 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  42.13 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 333 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  37.18 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.05 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  37.5 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.13 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.13 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.28 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  35.34 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  35.66 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  34.93 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  39.91 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  33.94 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  33.06 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.93 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.93 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.5 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.46 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.74 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.06 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 		 346 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.77 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.63 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.63 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.98 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  33.04 
 
 		 329 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  34.63 
 
 		 317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  34.63 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.4 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  35.24 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  36.41 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  33.19 
 
 		 360 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  30.24 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 336 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  32.33 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>